Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRAP18433 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRAP18433 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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