Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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