Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GGA3Q9NZ52 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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