Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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