Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms