Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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