Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHHQ15465 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SHHQ15465 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SHHQ15465 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHHQ15465 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHHQ15465 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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