Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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