Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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GPNMBQ14956 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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GPNMBQ14956 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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GPNMBQ14956 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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GPNMBQ14956 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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GPNMBQ14956 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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GPNMBQ14956 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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