Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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NFIXQ14938 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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NFIXQ14938 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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NFIXQ14938 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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NFIXQ14938 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIXQ14938 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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