Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms