Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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