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| RUNX3 | Q13761 | MTND1P31-201 | ENST00000449206 | 961 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | EMB-205 | ENST00000514111 | 1475 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC046195.1-201 | ENST00000518973 | 4171 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | CR383658.2-201 | ENST00000547576 | 1525 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XIAPP3-201 | ENST00000312918 | 795 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-283P-201 | ENST00000364788 | 107 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C3-201 | ENST00000379667 | 936 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL122016.1-201 | ENST00000403365 | 367 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1183-201 | ENST00000408856 | 89 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL669831.5-220 | ENST00000412115 | 581 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AMD1P2-201 | ENST00000412936 | 992 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAICSP7-201 | ENST00000419829 | 962 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005005.2-201 | ENST00000420779 | 380 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513175.2-201 | ENST00000422071 | 443 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020594.1-201 | ENST00000437680 | 338 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC009987.1-201 | ENST00000446888 | 806 nt | TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL589880.1-201 | ENST00000448271 | 287 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC093722.1-201 | ENST00000504882 | 489 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008948.1-201 | ENST00000506058 | 325 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027613.1-201 | ENST00000508414 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP341-201 | ENST00000516261 | 117 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA70.19-201 | ENST00000516717 | 90 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC023632.1-201 | ENST00000518463 | 375 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105180.1-201 | ENST00000523317 | 426 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DUXAP5-201 | ENST00000529668 | 529 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5AP1P-201 | ENST00000529730 | 940 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC022081.1-201 | ENST00000537327 | 433 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIGD1AP1-201 | ENST00000550979 | 275 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004217.3-201 | ENST00000551552 | 878 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005476.1-201 | ENST00000554427 | 397 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRP54-AS1-203 | ENST00000556355 | 603 nt | TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022166.2-201 | ENST00000566030 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BPTFP1-201 | ENST00000579209 | 492 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001542.2-201 | ENST00000593141 | 364 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113368.1-201 | ENST00000603736 | 382 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC110741.2-201 | ENST00000605278 | 268 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124312.4-201 | ENST00000605533 | 310 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C5orf63-207 | ENST00000606937 | 607 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011816.2-201 | ENST00000607089 | 556 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DAOA-AS1_2.2-201 | ENST00000610818 | 204 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013470.4-201 | ENST00000619978 | 986 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC120349.3-201 | ENST00000624377 | 529 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-AS1-266 | ENST00000630271 | 813 nt | TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092017.3-201 | ENST00000638880 | 536 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OSBPL9P4-201 | ENST00000371707 | 1800 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHC3-215 | ENST00000495893 | 12666 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTTP-201 | ENST00000265517 | 4037 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SGMS2-201 | ENST00000359079 | 1887 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNIP4-207 | ENST00000509207 | 1301 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02240-201 | ENST00000564199 | 1336 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |