Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms