Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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