Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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