Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms