Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms