Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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