Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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