Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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