Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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