Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CHD3Q12873 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CHD3Q12873 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CHD3Q12873 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD3Q12873 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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