Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3AP98173 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms