Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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