Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CRXO43186 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CRXO43186 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CRXO43186 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CRXO43186 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CRXO43186 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CRXO43186 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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