Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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