Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMTK3Q96Q04 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms