Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms