Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BBS9Q3SYG4 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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