Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms