Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms