Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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