Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD8Q15843 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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