Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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