Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPTX1Q15818 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms