Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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