Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms