Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms