Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms