Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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