Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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COL4A6Q14031 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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COL4A6Q14031 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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COL4A6Q14031 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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COL4A6Q14031 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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COL4A6Q14031 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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