Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CKAP5Q14008 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CKAP5Q14008 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CKAP5Q14008 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CKAP5Q14008 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CKAP5Q14008 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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