Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
APOFQ13790 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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