Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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