Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CUL3Q13618 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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CUL3Q13618 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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CUL3Q13618 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CUL3Q13618 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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