Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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