Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms