Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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