Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATMQ13315 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATMQ13315 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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